Le lac abrite également plus de 200 espèces de poissons, dont l’unique omoul du Baïkal, un type de saumon, symbole du lac Baïkal. Il abrite également de nombreuses espèces d’oiseaux, de reptiles et de mammifères. Certaines des espèces les plus remarquables du lac sont le nerpa, un phoque d’eau douce, et le golomyanka, un poisson translucide qui vit à de grandes profondeurs.